Početak projekta: 1.10.2025.

Streptococcus pneumoniae je jedan od vodećih uzročnika invazivnih bakterijskih infekcija, uključujući pneumoniju, sepsu i meningitis. Postoje brojni serotipovi pneumokoka koji pokazuju  značajne geografske razlike u distribuciji. Globalna i regionalna molekularna epidemiologija invazivnih sojeva pneumokoka još uvijek nije u potpunosti poznata jer evolucijski pritisci (cijepljenje, antibiotici) kontinuirano mijenjaju njihov genetski sastav. Varijabilnost serotipova i povećana rezistencija, osobito na beta-laktamske i makrolidne antibiotike, predstavlja ozbiljan javnozdravstveni problem, otežavajući prevenciju i liječenje infekcija. Cilj ovog istraživanja je  karakterizacija sojeva pneumokoka izoliranih iz kliničkih uzoraka (hemokultura, likvor) s posebnim naglaskom na analizu genskih profila i gena rezistencije na antibiotike najzastupljenijih serotipova. 

Izolati pneumokoka prikupljeni na Kliničkom zavodu za kliničku mikrobiologiju Kliničkog bolničkog centra Rijeka u periodu 2024. do 2026. godine bit će serotipizirani s ciljem određivanja opsega pokrivenosti serotipova trenutno dostupnim pneumokoknim cjepivima. Genotipizacija izolata pomoću MLST (od engl. Multilocus Sequence Typing) analize sekvenciranjem housekeeping gena omogućit će praćenje klonalne povezanosti sojeva. Analizirat će se i geni povezani s rezistencijom na beta-laktamske i makrolidne antibiotike.

Dobiveni podatci o sekvencijskim tipovima omogućit će filogenetsku analizu izolata te praćenje širenja rezistentnih i virulentnih klonova u populaciji. Očekivani ishodi istraživanja uključuju identifikaciju dominantnih serotipova i genotipova u populaciji, utvrđivanje obrazaca rezistencije na antibiotike i potencijalnu identifikaciju novih molekularnih markera za praćenje širenja rezistentnih sojeva. Ovi nalazi mogu imati značajan utjecaj na javno zdravlje i javno-zdravstvene mjere, pružajući osnovu za optimizaciju terapijskih protokola i imunizacijskih strategija protiv invazivnih pneumokoknih infekcija.