PORTFELJ / SVEUČILIŠNI PROJEKTI

Istraživački projekti 2025.-2029.

uniri-iz-25-24 Preemie-GEN

Varijabilnost genoma prijevremeno rođene djece: od sekvenciranja do funkcionalnih studija

Područje biomedicine i zdravstva/uniri projekti iskusnih znanstvenika

Početak projekta: 1.10.2025.

Prijevremeni porod jedan je od vodećih uzroka neonatalne smrtnosti i dugoročnih zdravstvenih komplikacija, a njegova etiologija uključuje složene genetičke, epigenetičke i metaboličke čimbenike. Iako su prethodna istraživanja identificirala genetičke varijante u genomu majki prijevremeno rođene djece, povezane s idiopatskim spontanim prijevremenim porodom (ISPP), funkcionalni mehanizmi koji povezuju ove promjene s metaboličkim i transkriptomskim profilima još uvijek nisu dovoljno istraženi. Istovremeno, sve veći broj dokaza upućuje na značajnu ulogu genetičkih čimbenika u genomima prijevremeno rođene djece za koje se pretpostavlja da varijaciji rizika za ISPP doprinose do čak 30%.

U skladu s time, cilj ovog istraživanja je identificirati genetičke varijante povezane s ISPP-om u prijevremeno rođene djece i procijeniti njihov potencijalni funkcionalni učinak. Navedeno će se provesti kroz četiri faze istraživanja. Prva faza uključuje sustavni pregled literature i metaanalizu kako bi se identificirali geni kandidati povezani s ISPP-om, čime će se formirati sveobuhvatan panel gena relevantnih za patogenezu bolesti. Druga faza obuhvatit će sekvenciranje cjelokupnog egzoma (WES) u prijevremeno rođene djece, pri čemu će se analizirati prisutnost genetičkih varijanti u cijelom egzomu i u panelu gena kandidata, uz naknadnu analizu opterećenja. Treća faza fokusirat će se na epigenetičke analize, odnosno ispitivanje funkcionalnog učinka identificiranih varijanti analizom metilacije promotora gena. Četvrta faza uključuje ciljano i neciljano metabolomsko profiliranje metodom LC-MS/MS, s ciljem istraživanja metaboličkih promjena povezanih s ISPP-om.

Očekuje se da će rezultati ovog istraživanja unaprijediti razumijevanje patofizioloških mehanizama ISPP-a te omogućiti razvoj preciznijih strategija za njegovu prevenciju i dijagnostiku, temeljenih na kombinaciji genetičkih, epigenetičkih i metaboličkih čimbenika.

Istraživački tim

Voditelj projekta

SURADNICI

Anita Barišić

Emilia Fornal

Aleš Maver

DOKTORANDI