Istraživački projekti 2025.-2029.
Varijabilnost genoma prijevremeno rođene djece: od sekvenciranja do funkcionalnih studija
Područje biomedicine i zdravstva/uniri projekti iskusnih znanstvenika
Prijevremeni porod jedan je od vodećih uzroka neonatalne smrtnosti i dugoročnih zdravstvenih komplikacija, a njegova etiologija uključuje složene genetičke, epigenetičke i metaboličke čimbenike. Iako su prethodna istraživanja identificirala genetičke varijante u genomu majki prijevremeno rođene djece, povezane s idiopatskim spontanim prijevremenim porodom (ISPP), funkcionalni mehanizmi koji povezuju ove promjene s metaboličkim i transkriptomskim profilima još uvijek nisu dovoljno istraženi. Istovremeno, sve veći broj dokaza upućuje na značajnu ulogu genetičkih čimbenika u genomima prijevremeno rođene djece za koje se pretpostavlja da varijaciji rizika za ISPP doprinose do čak 30%.
U skladu s time, cilj ovog istraživanja je identificirati genetičke varijante povezane s ISPP-om u prijevremeno rođene djece i procijeniti njihov potencijalni funkcionalni učinak. Navedeno će se provesti kroz četiri faze istraživanja. Prva faza uključuje sustavni pregled literature i metaanalizu kako bi se identificirali geni kandidati povezani s ISPP-om, čime će se formirati sveobuhvatan panel gena relevantnih za patogenezu bolesti. Druga faza obuhvatit će sekvenciranje cjelokupnog egzoma (WES) u prijevremeno rođene djece, pri čemu će se analizirati prisutnost genetičkih varijanti u cijelom egzomu i u panelu gena kandidata, uz naknadnu analizu opterećenja. Treća faza fokusirat će se na epigenetičke analize, odnosno ispitivanje funkcionalnog učinka identificiranih varijanti analizom metilacije promotora gena. Četvrta faza uključuje ciljano i neciljano metabolomsko profiliranje metodom LC-MS/MS, s ciljem istraživanja metaboličkih promjena povezanih s ISPP-om.
Očekuje se da će rezultati ovog istraživanja unaprijediti razumijevanje patofizioloških mehanizama ISPP-a te omogućiti razvoj preciznijih strategija za njegovu prevenciju i dijagnostiku, temeljenih na kombinaciji genetičkih, epigenetičkih i metaboličkih čimbenika.
Istraživački tim
Voditelj projekta
izv. prof. dr. sc. Sanja Dević Pavlić dipl. sanit. ing.
SURADNICI
dr.sc. Lara Saftić Martinović mag.pharm.inv.
Izv. prof. dr. sc. Nina Pereza dr. med.
Anita Barišić
Emilia Fornal
Aleš Maver
DOKTORANDI
Tea Mladenić