Istraživački projekti 2025.-2029.
Identifikacija citomegalovirusnog gena koji pokreće stvaranje odjeljka za sklapanje viriona
Područje biomedicine i zdravstva/uniri projekti za materijalno zahtjevna istraživanja
Humani citomegalovirus (HCMV), važan humani patogen koji inficira većinu populacije, ekstenzivno preuređuje membranski sustav stanice i stvara veliku strukturu poznatu kao odjeljak za sklapanje viriona (engl. assembly compartment, AC). Razvoj AC odvija se sličnim slijedom u stanicama inficiranim mišjim CMV-om (MCMV). Za razliku od HCMV-a, gdje se AC razvija od 24 do 72 sata nakon infekcije, temeljna konfiguracija AC (preAC) u stanicama inficiranim s MCMV-om uspostavlja se brzo, u razdoblju 5-7 sati nakon infekcije. To omogućuje uspostavljanje tehnički prikladnijih eksperimentalnih pristupa u nastojanju da se odgovori na pitanje kako nastaje AC, jedno od ključnih pitanja za razumijevanje biologije i patogeneze CMV infekcije na koje se pokušava odgovoriti u posljednjih 25 godina.
Od nedavno dostupan kodirajući potencijal MCMV-a pokazuje da 170 gena izražava 380 virusnih transkripata. U ranoj fazi infekcije prije uspostavljanja preAC, izražavaju se 34 (β1) i 55 (β2) transkripta u dva slijedna vala. Cilj ovoga projekta je uporabom kontroliranog izražaja β1 i β2 gena, delecijskih mutanti MCMV-a i siRNA identificirati virusni gen koji izaziva nastanak preAC (virusni transkript za preAC, VT-preAC). Biogeneza preAC pratit će se imunofluorescencijom, konfokalnom i digitalnom holotomografskom (DHTM) mikroskopijim kao dislokacija Golgijeva kompleksa i tubulacija endosomalnog sustava. Produkt identificiranog VT-preAC će se detaljno karakterizirati biokemijski i funkcionalno. Transfekcijom VT-preAC će se izazvati slična konfiguracija u neinficiranim stanicama a sa shRNA za VT-preAC i siRNA za virusne gene istražit će se uloga M48, M94 i M103 u biogenezi AC. GFP-VT-preAC će se koristiti za snimanje na živim stanicama DHTM-om i analize s markerima membranskog sustava. VT-preAC-BioID2 će se koristiti u BioID testu i maseno-spektrometrijsku identifikaciju staničnih proteina s kojim VT-preAC stupa u interakciju (interaktom) kako bi se identificirao mehanizam biogeneze preAC i AC.
Istraživački tim
Voditelj projekta
Prof. dr. sc. Pero Lučin dr. med.
SURADNICI
Prof. dr. sc. Hana Mahmutefendić Lučin dipl. ing. biol.
Prof. dr. sc. Gordana Blagojević Zagorac dr. med., mag. oec.
doc. dr.sc. Ljerka Karleuša dipl.ing.bioteh.
Dr. sc. Martina Deželjin
Dr. sc. Marina Marcelić mag.pharm.inv.
Silvija Lukanović Jurić dr.med.
Ivona Viduka mag. biotech. in med.
Prof. dr. Jaakko Saraste
Prof. dr. Zsolt Ruzsics
Elizabeta Kostelac dr.med.
DOKTORANDI
Alen Omerović