Početak projekta: 1.10.2025.

Tehnologija sekvenciranja RNA pojedinačnih stanica (scRNA-Seq) omogućila je određivanje razine ekspresije gena u pojedinačnim stanicama i time revolucionalizirala naše razumijevanje raznih bioloških procesa. Primjerice, primjena ove tehnologije rezultirala je identifikacijom prethodno nepoznatih tipova stanica u raznim tkivima, pružila je dublji uvid u heterogenost populacija stanica u tumorima, te je omogućila preciznije mapiranje razvoja raznih staničnih tipova i načina na koji stanice nakon podražaja mijenjaju svojstva i prelaze iz jednog u drugi tip stanica, čime je značajno unaprijeđeno naše razumijevanje fizioloških procesa u homeostazi i raznim bolestima. Cilj ovog projektnog prijedloga jest primijeniti scRNA-Seq za istraživanje promjena u razini ekspresije gena pojedinačnih stanica, a koje nastupaju nakon infekcije mozga, srca, jajnika i nadbubrežnih žlijezda citomegalovirusom (CMV), ili pluća nakon imunizacije miševa rekombinantnim cjepivom temeljenim na citomegalovirusu (rCMV). Naime, humani CMV (HCMV) je jedan od najrasprostarnjenijih virusa u svijetu, koji kod nerođene ili novorođene djece može uzrokovati cijeli niz teških i dugoročnih neuroloških i drugih posljedica. HCMV je, u većoj ili manjoj mjeri, impliciran i kao faktor rizika za tumorske i kardiovaskularne bolesti, imunosenescenciju, metaboličke i autoimune poremećaje u odraslih. Koristeći odgovarajuće animalne modele, u našem laboratoriju u sklopu drugih projekata proučavamo posljedice infekcije mozga, jajnika, srca, nadbubrežnih žlijezdi i pluća nakon infekcije citomegalovirusom ili imunizacijom miševa rCMV-om. U sklopu ovog projekta, navedena istraživanja planiramo unaprijediti scRNASeq analizom navedenih organa kako bismo stekli dublji uvid u mehanizme imunološkog odgovora i/ili nastanka funkcionalnih deficita izazvanih CMV-om, te na taj način ujedno povećali kapacitet Medicinskog fakulteta Sveučilišta u Rijeci za provedbu kompetitivnih istraživanja uz primjenu vrhunskih tehnologija.